L'EMF dépend du Service cantonal de la formation professionnelle (SFP). Pour assurer au mieux sa mission de service public, elle entretient des relations suivies, contractuelles ou non, avec de nombreuses organisations et entreprises. L'EMF est véritablement à la fois acteur et partenaire des associations professionnelles et de formation.

Elle participe activement aux mouvements associatifs de la formation professionnelle qui la concerne :
Fédération des Ecoles Techniques et de métiers (FET-VTS-FST)
Conférence Suisse des Directeurs d'écoles professionnelles et de métiers (CSD-SDK)

Elle collabore étroitement avec les Associations professionnelles fribourgeoises :
Clusters « Energie et Bâtiment » / « Réseau Plasturgie » / « IT-VALLEY »
Association fribourgeoise de la mécanique, de l'électricité et des machines (FRIMECA)

L'EMF entretient des relations avec diverses entreprises, pour rechercher des places de stages pour ses apprenti-e-s ou comme prestataire de développement de produits et services. Cette collaboration favorable aux apprenti-e-s est également intéressante pour les entreprises; elle tend à se développer. Des stages, visites et portes ouvertes complètent l'information réciproque.

L'EMF entretient également une proche collaboration avec l’EIAF - Ecole d'Ingénieurs et Architectes de Fribourg (HES-SO Fribourg). 3 apprenti-e-s sur 4 formé-e-s à l'EMF dans les sections ergonEMF et logusEMF poursuivent une formation d'ingénieur-e à l'EIAF où ils sont admis-e sans examen.